Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Pcsk9Q80W65 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Pcsk9Q80W65 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pcsk9Q80W65 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Pcsk9Q80W65 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms