Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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