Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc29Q80VM3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Ttc29Q80VM3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc29Q80VM3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc29Q80VM3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc29Q80VM3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc29Q80VM3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc29Q80VM3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc29Q80VM3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc29Q80VM3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc29Q80VM3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc29Q80VM3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc29Q80VM3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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