Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rims3Q80U57 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rims3Q80U57 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rims3Q80U57 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms