Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms