Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pja2Q80U04 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja2Q80U04 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms