Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Clec18aQ7TSQ1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Clec18aQ7TSQ1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Clec18aQ7TSQ1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Clec18aQ7TSQ1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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