Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcdh8Q7TSK3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdh8Q7TSK3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms