Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Dsg1bQ7TSF1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Dsg1bQ7TSF1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Dsg1bQ7TSF1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Dsg1bQ7TSF1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Dsg1bQ7TSF1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Dsg1bQ7TSF1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Dsg1bQ7TSF1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms