Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dsg1cQ7TSF0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dsg1cQ7TSF0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms