Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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Nek5Q7TSC3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Nek5Q7TSC3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Nek5Q7TSC3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Nek5Q7TSC3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek5Q7TSC3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms