Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec4b1Q7TS58 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms