Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LnpkQ7TQ95 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LnpkQ7TQ95 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LnpkQ7TQ95 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LnpkQ7TQ95 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LnpkQ7TQ95 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LnpkQ7TQ95 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LnpkQ7TQ95 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LnpkQ7TQ95 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LnpkQ7TQ95 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms