Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letm2Q7TNU7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letm2Q7TNU7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.4 ms