Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trappc6aQ78XR0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trappc6aQ78XR0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trappc6aQ78XR0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc6aQ78XR0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms