Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms