Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rph3alQ768S4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms