Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms