Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Glis3Q6XP49 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Glis3Q6XP49 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms