Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms