Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cxcl3Q6W5C0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms