Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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Atp8b3Q6UQ17 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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Atp8b3Q6UQ17 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Atp8b3Q6UQ17 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Atp8b3Q6UQ17 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Atp8b3Q6UQ17 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b3Q6UQ17 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms