Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Timd4Q6U7R4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Timd4Q6U7R4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Timd4Q6U7R4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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