Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc154Q6RUT8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms