Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RimklaQ6PFX8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms