Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scaf4Q6PFF0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms