Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmeff1Q6PFE7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms