Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms