Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc85bQ6PDY0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc85bQ6PDY0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms