Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vstm2lQ6PDS0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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