Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrp12Q6P5B0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms