Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms