Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stmnd1Q6P3A1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stmnd1Q6P3A1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms