Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp140Q6NSQ5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms