Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms