Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms