Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lemd2Q6DVA0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms