Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms