Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Msl2Q69ZF8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Msl2Q69ZF8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Msl2Q69ZF8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msl2Q69ZF8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms