Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp4Q68FH0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp4Q68FH0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms