Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CltcQ68FD5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms