Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbno1Q689Z5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms