Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CilpQ66K08 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CilpQ66K08 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms