Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8eQ66JT1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms