Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atp4aQ64436 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atp4aQ64436 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atp4aQ64436 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Atp4aQ64436 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atp4aQ64436 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Atp4aQ64436 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp4aQ64436 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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