Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pan3Q640Q5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms