Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms