Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sall3Q62255 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sall3Q62255 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms