Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema5aQ62217 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms