Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SnrpaQ62189 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms